BLASTP 2.2.11 [Jun-05-2005] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= gi|189181720 proteoglycan 4 isoform B [Homo sapiens] (1363 letters) Database: hs.faa 37,866 sequences; 18,247,518 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gi|189181720 proteoglycan 4 isoform B [Homo sapiens] 2807 0.0 gi|67190163 proteoglycan 4 isoform A [Homo sapiens] 2787 0.0 gi|189181724 proteoglycan 4 isoform D [Homo sapiens] 2492 0.0 gi|189181722 proteoglycan 4 isoform C [Homo sapiens] 2492 0.0 gi|116284392 mucin 2 precursor [Homo sapiens] 395 e-109 gi|163965366 nascent polypeptide-associated complex alpha subuni... 306 7e-83 gi|238624188 diffuse panbronchiolitis critical region 1 protein ... 250 6e-66 gi|239749951 PREDICTED: similar to mucin 2 [Homo sapiens] 229 1e-59 gi|239740773 PREDICTED: similar to diffuse panbronchiolitis crit... 228 2e-59 gi|91982772 mucin 17 [Homo sapiens] 202 2e-51 gi|132626688 mediator of DNA-damage checkpoint 1 [Homo sapiens] 202 2e-51 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162 3e-39 gi|239757995 PREDICTED: similar to hCG1747327, partial [Homo sap... 159 2e-38 gi|239508976 PREDICTED: mucin 12, cell surface associated [Homo ... 158 3e-38 gi|239754668 PREDICTED: mucin 12 [Homo sapiens] 158 4e-38 >gi|189181720 proteoglycan 4 isoform B [Homo sapiens] Length = 1363 Score = 2807 bits (7276), Expect = 0.0 Identities = 1363/1363 (100%), Positives = 1363/1363 (100%) Query: 1 MAWKTLPIYLLLLLSVFVIQQVSSQELSCKGRCFESFERGRECDCDAQCKKYDKCCPDYE 60 MAWKTLPIYLLLLLSVFVIQQVSSQELSCKGRCFESFERGRECDCDAQCKKYDKCCPDYE Sbjct: 1 MAWKTLPIYLLLLLSVFVIQQVSSQELSCKGRCFESFERGRECDCDAQCKKYDKCCPDYE 60 Query: 61 SFCAEVHNPTSPPSSKKAPPPSGASQTIKSTTKRSPKPPNKKKTKKVIESEEITEEHSVS 120 SFCAEVHNPTSPPSSKKAPPPSGASQTIKSTTKRSPKPPNKKKTKKVIESEEITEEHSVS Sbjct: 61 SFCAEVHNPTSPPSSKKAPPPSGASQTIKSTTKRSPKPPNKKKTKKVIESEEITEEHSVS 120 Query: 121 ENQESSSSSSSSSSSSTIRKIKSSKNSAANRELQKKLKVKDNKKNRTKKKPTPKPPVVDE 180 ENQESSSSSSSSSSSSTIRKIKSSKNSAANRELQKKLKVKDNKKNRTKKKPTPKPPVVDE Sbjct: 121 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Search results were obtained with NCBI BLAST and RefSeq entries.
Guide to the Human Genome
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